Anthropic объявила о предварительных результатах исследовательской программы в области наук о жизни, в рамках которой агенты Claude анализируют крупные базы данных последовательностей ДНК и предлагают ранее не описанные биологические системы. В ходе этой работы агенты выявили новую ферментную систему, связанную с повторами ДНК, структурно напоминающими массивы CRISPR, и компания назвала её Array-associated reverse transcriptases, или ART.
Anthropic пока не знает основную функцию системы, поэтому не представляет её как инструмент редактирования генов или готовую к использованию технологию. Однако предварительные результаты указывают на сочетание редких характеристик в одной системе: обратной транскриптазы, соседнего партнёрского гена и длинного массива равномерно расположенных повторов ДНК. ART в основном встречается в фагах — вирусах, поражающих бактерии.
Как Claude обнаружил систему?
Исследователи поручили Claude искать новые и интересные примеры обратных транскриптаз в обширной базе данных. Примерно через 21 час, в течение которых работали около 950 агентов, использовавших 210 миллионов токенов, агенты собрали более 200 000 обратных транскриптаз и выявили 3500 систем-кандидатов, после чего сократили их число до 20 кандидатов для подготовки аналитических отчётов, которые должны были изучить учёные.
Один из агентов обратил внимание на обратную транскриптазу с необычным видом, затем исследовал окружающую её последовательность ДНК и заметил массив соседних повторов. После этого он измерил количество повторов и расстояния между ними, сравнил их с известными системами, изучил научную литературу и передал результат на проверку людям.
Что показали эксперименты?
Согласно опубликованным результатам, ART состоит из трёх основных компонентов: обратной транскриптазы, расположенного рядом партнёрского гена и массива повторов ДНК. Первые эксперименты показали, что массив также экспрессируется в виде набора отдельных коротких молекул РНК, что допускает существование функционального механизма, связанного с этими повторами, однако источник пока не подтверждает их природу или роль.
Сходство с CRISPR связано со структурой массива и идеей производства нескольких последовательностей РНК; однако это структурное сходство не означает, что ART работает таким же образом или является программируемой системой. Anthropic заявляет, что биохимические и структурные эксперименты для определения функции системы продолжаются.
Почему эта новость важна?
Значение результата заключается в демонстрации практической модели использования искусственного интеллекта для расширения масштабов геномного поиска, а не в объявлении о полностью готовом биологическом инструменте. Задачу, на которую у специалиста могли бы уйти недели или месяцы, — поиск в семействах неописанных белков и сравнение их геномных соседей — агенты выполнили в широком масштабе, после чего учёные приступили к проверке кандидатов в лаборатории.
Anthropic подчёркивает, что люди по-прежнему отвечали за лабораторную работу и проверку результатов, а её лаборатория работает в пределах уровней биобезопасности BSL-1 и BSL-2 и не занимается патогенами, поражающими людей. Кроме того, результат пока остаётся предварительным открытием, опубликованным в виде исследовательского препринта; функция, программируемость и любые возможные терапевтические или инженерные применения ART остаются открытыми вопросами, требующими независимой проверки и дополнительных экспериментов.